QTClip はアイコンの右クリックから、いくつかのキー設定
が変更できます。

ポップアップメニューの項目を選んではりつけるときは、
まずポップアップメニューを出す（このキーは自由設定）、
カーソルキーあるいはメニューに付属のショートカット
キーで選択、という手順なので、ここで Ctrl + V を使
う場面はないと思います。（決定は項目のショートカット
キーを使わなければ Enter。）

これでもなく、他の場面のことでしょうか。

エディタの中での貼りつけのキーは、エディタのほうでの
設定です。