>私の環境でクライアントで入力した CTRL-Z が ホスト側の特定のアプリケーションで
>CTRL-Y と認識されてしまうという現象が出ています。

　ぎょっ...
http://0ban.com/araken/uralib/mmm0523.lzh
を試してみてください。



>・クライアント側のRemote Saucerのウィンドウ（”Shift ScrollLockで終了”と表示
>されている部分）をクリックで切り替え可能にする

　クリックだけだと、アクティブにするときのクリックでも切り替わるので問題があるかも。


>・クライアント側のRemote Saucerのウィンドウを小さく（アイコン位の大きさ）
> または可変

　これは、クライアントの画面を見ながらサーバを操作したいという用途でしょうか？


>・クライアント側のRemote Saucer起動時にはクライアント側の操作のまま起動する

　考えます。