クリップボード履歴(C)
では、連続した改行は一つにまとめられます。そういう仕様です。


テキスト履歴(T)
を使ってください。

QTClipのアイコンを右クリックして「開く(O)」

「クリップボード履歴」
の窓から、目的の文字列をドラッグして、
「テキスト」
の窓へ落とします。

「クリップボード履歴」に登録した文字列は、連続した改行もそのまま保存さ
れます。再起動してもそのまま。
画面上のスラッシュの数で改行の数を確認できます。