QTCLIPを最近になって知り、便利に使わせて頂いています。
初歩的な質問で申し訳ないのですが。
”スタートアップフォルダに 実行時の大きさ が 最小化 のショートカットを登録”
最小化 のショートカットの具体的な手順が分かりません。
宜しくお願いします。

>最小化 のショートカットの具体的な手順が分かりません。

ショートカットの作成はできている、として、最小化の部分のみ説明します。

ショートカットのプロパティを表示します。
「ショートカット」タブの下のほうに「実行時の大きさ」という項目があります。
ここを「最小化」にして「OK」。

以上です。