ただいま私のPCで発生しています。発生したときはExcelシートからコピーしたものが
QTClipに入ったままになっています。この時の貼り付け先はExcelだったと思います。

設定ウインドウでは下3つにチェックが入っています。ホットキーは(A)は設定なし、
(D)はAlt+X、(T)はAlt+Cにしています。

この状態でタスクマネージャのアプリケーションタブで出ている全てのアプリケーションを
止めて、タスクトレイに有るものも出来るだけ止めてから、メモ帳を開いて12345と
入力し、12345をコピーしましたが、QTClipには入りませんでした。メモ帳上で貼り付けを
おこなうと12345と張り付きます。

QTClipに入ってくる少し前のクリップボードの内容(b)をメモ帳に貼り付けると張り付きます。
(b)もQTClipのクリップボード履歴の一番上に移動しました。

ここで、新たに678910をコピーしてもQTClipには入りません。メモ帳に貼り付けでは
678910が張り付きます。

ここで、QTClipを終了させ、再起動させるとQTClipのクリップボードには678910が1個だけ
入っています。別の文字列をコピーするとQTClipに入ります。再起動で元の正常な状態に
もどりました。

以上、ご報告まで。