QGrep はわたしも便利に使っています。

>「A.CD」というふうに正規表現が使えると思うのですが

正規表現で検索、うまくいかないのでしょうか。まさにそのとおりでいいと思う
のですが……。ダイアログの右上の「正規表現」をオンにしての検索のお話です
よね……？　どの文字でもいいのではなく、アルファベット大文字である、とか
なら、A[A-Z]CD とか？