>IMEの未確定文字のフォントが、確定文字のフォントより大きく表示されてしまいます。どこかで設定するのでしょうが、共通設定でも書式設定でも見つけられません。どこで設定するか教えて下さい。

　思い当たることがほとんどないのですが、「共通設定」−「IME/ｱｲｺﾝ」で、
「未確定文字を@FixedSysで表示」をチェックしていると、縦書き編集時に、
使用しているフォントのサイズによってはそのようになるようです。
@FixedSys のサイズが固定されているためでしょう。

　それとも、そういう単純なことではないのでしょうか。