AL-Mail を使っていないので、ごく一般論のみにて。

>メーラー側で外部エディタを次の２通りで指定しました。
>\qxw32.exe -2
>\qxw32.exe -2 -*.m70

この下の「*」が入ってるのはムリじゃないかと思いますが、できたのでしょうか。
メーラーによって、テキストエディタを指定するときに渡すパスが違って
きます。ファイル名はメーラーのほうで決まることが多いのではないでしょうか。

書式設定を反映させるには、開くファイルの拡張子が、適用したい書式で
登録されている必要があります。適用されるのは保存された書式のリストの
上から順に、登録拡張子が一致したものが選択されます。

>また、QXを終了することでメーラー側に文書が引き渡されるのですが、QX側のtempファイルがメールを作成するたびに溜まってしまいます。溜まらないようにする方法はあるのでしょうか？

たぶんないと思いますので、時々手動で掃除するあたりでいかがですか。
自動実行マクロを組むとか、なかなか面倒になりそうですので。