手元で試してみた限りでは問題はないようです。
実行すると自動的にカーソルが最初に違いが見付かった箇所に移動します。
当然ですが、カレント文書と参照用文書のカーソル位置の文字が異っている場合には
カーソルはそれ以上移動しません。
比較するファイルやカーソル位置などの条件を変えて実行してみても駄目ですか？