ほぼ2年ぶりの投稿です。
QTClip Ver2.6殿には毎日、バリバリ何時間も働いて戴いていますおり、
心から感謝しております。
# タスクマネージャ見たCPU時間でのランキングでも上位入賞です 8^)

さて、本題ですが、
Windows2000 Professional(5.00.2195 Service Pack2適用済み)で
使っているのですが、どいう訳かクリップボード履歴が
途中で止まることがあるようです。
ポップアップメニューからの入力は正常にできているので、
何が引き金となって止まっているのか、まだ、特定できていません。

同様の報告はなされていないでしょうか?

私が日常的に使っているソフトは下記の通りです。
OfficeXP, IE5.5SP2, AL-Mail, 秀丸(QXユーザでなくて申し訳ないっす),
ATOK13, TeraTerm