島田です。rider さん、初めまして。
そのエディタはマクロが使えますでしょうか？
もし使えるのなら、
ちょっと試したわけではないのですが（汗）
ひとつの提案として。
１．QTClip のポップアップメニューに割り当てたホットキーが押されているか
　　どうかをチェック。
２．押されていたらペーストを実行。
２．でなければ、通常 Ctrl+V に割り当てている機能を実行。
というマクロを組んで Ctrl+V に割り当てるというのは、いかがでしょう？