手元で試してみた限りでは問題はないようです。実行すると自動的にカーソルが最初に違いが見付かった箇所に移動します。当然ですが、カレント文書と参照用文書のカーソル位置の文字が異っている場合にはカーソルはそれ以上移動しません。比較するファイルやカーソル位置などの条件を変えて実行してみても駄目ですか？